Esta iglesia tiene encomendada la Pastoral de Liturgia a un grupo de fieles que prestan su apoyo desinteresado en las labores pastorales, manifestando así su especial devoción al Santísimo Cristo de las Penas.

La mayoría de hombres y mujeres que colaboran en esta pastoral pertenecen a la Antigua Cofradía del Cristo de las Penas, que tiene su sede en esta Iglesia de San Juan del Hospital.

Además de las Procesiones de Semana Santa y del Corpus Christi y de participar en el Vía Crucis de la Archidiócesis, este activo grupo desarrolla durante el año las actividades ordinarias propias de la Pastoral.

Entre las actividades de carácter extraordinario destacan el Vía Crucis los viernes de Cuaresma, el Santo Rosario todos los días de Mayo y Octubre, la visita a la cárcel en la festividad de Reyes y las diversas bendiciones programadas en la Agenda anual de la iglesia.

Antigua Cofradía del Cristo de las Penas

FIESTA DE LA EXALTACIÓN DE LA SANTA CRUZ: el día 14 de Septiembre Exaltación de la Santa Cruz. Misa a las 19,00 h.y Bendición con el Lignum Crucis

FIESTA DE LA COFRADÍA: el domingo anterior al de Ramos. Misa solemne a las 19,00 h. Se celebra la investidura de los nuevos cofrades y se otorga la distinción de Dama-cofrade a las nuevas Clavariesas, las insignias a los cofrades infantiles y se impone la medalla de la Cofradía a los nuevos miembros.